El Museo Napoleónico de la Misericordia en Portoferraio se encuentra junto a la Iglesia de la Misericordia, construida en el 1677, y contiene reliquias del exilio de Napoleón en la Isla de Elba. 
El museo está dividido en tres salas: en la primera se encuentra una estatua de mármol del siglo XIV atribuida a Tino di Camaino (escuela de Pisa) que representa a una Madonna con el Niño, pero también hay algunas pinturas de los siglos XVII y XVIII que representan rostros de Santos e imágenes sagradas, además, se puede apreciar el primer estatuto de la Archicofradía de la Misericordia (1566), un preciado antifonario (1676), pero también exvotos, vestimentas, paramentos y objetos sagrados que son las demostraciones de más de cuatro siglos de vida de la Institución.