L'Abbaye a été la Cathédrale de Fiesole du haut Moyen Âge jusqu'en 1028. Le bâtiment a subi de nombreuses modifications au fil du temps, réalisées d'abord par les moines camaldules, puis par les bénédictins de Montecassino et les Chanoines Réguliers de Saint Augustin. L'édifice actuel date du XVe siècle et a été commandé par Cosme « le Vieux » de Médicis, qui a fait agrandir l’ancienne structure. Des architectes célèbres tels que Brunelleschi et Michelozzo ont travaillé à l'amélioration de l'abbaye.
Au fil des siècles l'église a eu de nombreuses utilisations : hospice pour les malades incurables de Florence, maison pour les soldats de Charles V ou utilisée comme simple habitation. Aujourd'hui, l’édifice abrite principalement l'Institut Universitaire Européen.
L’intérieur comporte une seule nef voûtée en berceau, avec plusieurs chapelles de part et d'autre, dont la Chapelle de l'Annonciation, qui contient une peinture de Raffaellino del Garbo. L'autel principal date de 1610 et il est attribué à Giovan Battista Cennini, qui a réalisé un projet de Pietro Tacca. À l'intérieur on trouve également un relief de l'école de Jacopo della Quercia et une Déposition de Botticini. En traversant le cloître Renaissance de l'ancien couvent, on atteigne le réfectoire, orné de fresques du XVIIe siècle réalisées par Giovanni da San Giovanni.
À admirer de l'extérieur l'originalité de la façade romane florentine, avec son alternance de marbre blanc et vert que l'on retrouve également à Florence dans le Baptistère et l'église de San Miniato al Monte.
