Die Kirche San Giovanni Fuorcivitas verdankt ihren Namen der Tatsache, dass sie außerhalb des ursprünglichen Stadtgebiets von Pistoia erbaut wurde, das im Mittelalter innerhalb des ersten Mauerrings lag. Wahrscheinlich stand hier ursprünglich eine Kirche der Langobarden, die nach der Konversion zum Christentum ihren Glauben mit dem Bau eines dem Apostel Johannes geweihten Gotteshaus beweisen wollten.
Der Bau der neuen Kirche begann im 12. Jahrhundert im romanischen Stil. Das Gebäude zeichnet sich durch die reiche zweifarbige Dekoration aus.
Die Nordseite schmücken hohe Blendarkaden, über denen zwei Reihen Blendbögen angeordnet sind. Den Mittelpunkt nimmt das Portal ein, das ein Architrav und ein Bogen mit der vom Bildhauer Gruamonte geschaffenen Darstellung vom Letzten Abendmahl zieren. Diese Seite sticht durch die horizontal angeordnete Verkleidung aus weißem Marmor und grünem Serpentin aus Prato hervor, ein Merkmal, das auf die pisanische Schule zurückzuführen ist. Wunderschön ist außerdem der Kreuzgang aus Stein und Tonfliesen mit Majolika-Schmuck.
Im 14. Jahrhundert wurde San Giovanni mit Artbeiten der bedeutendsten Künstler der Zeit ausgestattet: Fra' Guglielmo da Pisa schuf die mit polychromer Glaspaste verzierten Reliefs der Kanzel, mit den Geschichten Jesu Christi und der Heiligen Jungfrau, Giovanni Pisano arbeitete wahrscheinlich am marmornen Taufbecken im Zentrum der Kirche und Taddeo Gaddi malte das Polyptychon mit der Thronenden Madonna zwischen den Heiligen Jakobus, Johannes dem Evangelisten, Petrus und Johannes dem Täufer. Darüber hinaus schmücken Meisterwerke von Luca della Robbia die Kirche, darunter eine Gruppe aus glasierter Terrakotta, die Mariä Heimsuchung darstellt.
